2013 - 2014 Sezonu Bölgesel Amatör Lig müsabakalarının kura çekimi İstanbul'da Orhan Saka Amatörler Evi'nde yapıldı. TFF Yönetim Kurulu üyesi ve Profesyonel Kurul Başkanı Arif Koşar ve TFF Yönetim Kurulu üyesi ve Amatör İşler Kurulu Başkanı Ali Düşmez ve TFF Genel Sekreter Yardımcısı Adnan Ersan katıldı.
11 Grupta oynanan Bölgesel Amatör Lig'de grup ikincisi olan takımların katıldığı birinci tur kura çekiminde;
Sultanbeyli Belediyesor - Çatalcaspor,
İstanbul Halide Edip Adıvarspor - Sorgun Belediyespor,
Tatvan Gençlerbirliğispor - Niğde Belediyespor,
Sincan Belediyespor - Yomraspor-Dersimspor müsabakasının galibi eşleşti.
44 Malatyaspor, İzmirspor ve 8.Grup ikincisinin belirleneceği Somaspor - Manisa Belediyespor müsabakasının galibi ise birinci tur maçlarını BAY geçecek.
Birinci tur müsabakalarının tamamlanmasından sonra galip gelen dört ve BAY çeken üç takım 11 grup birincisiyle final müsabakalarını oynayacak. Bu eşleşmeleri kazanan 9 takım Spor Toto 3. Lig'e çıkma hakkını kazanacak.